Bayloz Darbe Planı belgelerinde ortaya çıkan, Fatih Camii'nin bombalanarak yerle bir edileceği ve halkın büyük bir kaosa sürükleneceği orta çıkmıştı.
Belgelerin ortaya çıkmasıyla darbecilerin planlarının suya düşmesi, Fatih Camii'nin de yıkılıp, yerle bir edileceği planlarının geri tepmesine neden olmuştu.
Balyozcuların büyük uğraş verdikleri, fakat ellerine yüzlerine bulaştırdıkları Fatih Camii'ni yıkma planları, bu kez farklı bir açıdan göndeme geldi.
17 Ağustos 1999 depreminin yıldönümü olması itibarıyla, bir kez daha göndeme gelen deprem bölgeleri, Fatih Camii'ni de içine aldı.
Bundan sonra olacak herhangi bir depremde Fatih Camii'nin dayanamayacağı söylentileri giderek artıyor.
Boğaziçi Üniversitesi Kandilli Rasathanesi Ve Deprem Araştırma Enstitüsü Müdürü Prof. Dr. Erdik yaptığı açıklamada, İstanbul'da ortalama 7 şiddetinde yaşanacak bir deprem sonrasında Fatih Camii'nin yıkılacağını söyledi.