Kupanın formatı tamamen değiştirilirken, organizasyon, eleme turu, grup ve final olmak üzere 3 aşamada düzenlenecek. 

Kupada amatörler de dahil olmak üzere toplam 156 takım yer alacak. Birinci eleme turu 86 takımın katımıyla başlayacak. 

-Katılacak takımlar- 

Yeni statüde kupaya katılacak takımlar şöyle belirlendi: 

2012-2013 sezonunda profesyonel liglerde takımı bulunmayan illerden Bölgesel Amatör ligde yer alacak 27 takım, 2012-2013 sezonunda profesyonel liglerde takımı bulunmayan il merkezlerinden, 2011-2012 sezonunda Bölgesel Amatör Lig'e düşen veya 2011-2012 sezonunda Bölgesel Amatör'de kendi ilindeki takımlar arasında en üst sırada yer alan toplam 4 takım, 2012-2013 sezonunda profesyonel liglerde takımı bulunmayan illerden, bu sezon Bölgesel Amatör Lig'e katılmaya hak kazanmakla birlikte katılmayan takımın ilde baraj maçı oynadığı 1 takım, 2012-2013 sezonunda Spor Toto 3. Lig'de yer alacak olan 54 takım, 2012-2013 sezonunda Spor Toto 2. Lig'de yer alacak 34 takım, 2012-2013 sezonunda TFF 1. Lig'de yer alacak 18 takım, 2012-2013 sezonunda Avrupa kupalarına katılamayan 13 Spor Toto Süper Lig takımı, 2012-2013 sezonunda Avrupa kupalarına katılan 5 Spor Toto Süper Lig takımı. 

-Müsabaka sistemi- 

Türkiye Kupası yeni sezonda eleme turu, grup ve final olmak üzere 3 aşamada oynanacak. 

Eleme aşaması, birinci, ikinci, üçüncü, dördüncü ve beşinci eleme turlarından oluşacak. 

Grup aşamasının ardından, yarı final ve finalin bulunduğu final aşamasına geçilecek. 

-Eleme aşaması- 

Tek maç eleme usulüyle oynanacak müsabakalarda, maçların normal süresinin berabere tamamlanması halinde 15'er dakikalık iki devre halinde uzatma oynanacak. Uzatmada da eşitliğin bozulmaması halinde tur atlayan takım seri penaltı atışları sonucunda belirlenecek. 

Birinci Eleme Turu: 

Bu turda müsabakalar, statünün 1. maddesindeki 32 amatör takım ve 54 Spor Toto 3. Lig takımı olmak üzere toplam 86 takım arasında, bölgesel olarak oynanacak. Eşleşmeler kuraçekimi ile belirlenecek. Müsabakalar, tek maç eleme usulüne göre küçük numarayı çeken takımın sahasında oynanacak ve maçları kazanan 43 takım tur atlayacak. 

İkinci Eleme Turu: 

Bu turda müsabakalar, Birinci Eleme Turu müsabakaları sonucunda tur atlayan 43 takımla,yeni sezonda Spor Toto 2. Lig'de yer alacak 34, TFF 1. Lig'de yer alacak 18, Avrupa kupalarına katılamayan 13 Spor Toto Süper Lig takımı olmak üzere toplam 108 takım takım arasında seri başı sistemine göre oynanacak. 

Kura çekimine Spor Toto Süper Lig'den 13 takım, TFF 1. Lig'de yer alan 18 takım ile 2011-2012 sezonunda Spor Toto 2. Lig Kırmızı Grup'ta 2, 3, 4, 5, 6, 7 ve 8. sırada ve Beyaz Grup'ta 2, 3, 4, 5, 6 ve 7. sırayı alan takımlar, seri başı olarak katılıp, Birinci Eleme Turu müsabakalarısonucunda tur atlayan 43 takımla eşleşecek.  2012-2013 sezonunda Spor Toto 2. Lig'de yer alıp seri başı olamayan 22 takım ise kendi arasında eşleşecek. 

Eşleşmeler kura çekimiyle belirlenip, müsabakalar, tek maç eleme usulüne göre, küçüknumarayı çeken takımın sahasında oynanacak ve maçlarını kazanan 54 takım tur atlayacak. 

Üçüncü Eleme Turu: 

Bu turda müsabakalar, İkinci Eleme Turu müsabakaları sonucunda tur atlayan 54 takım arasında, seri başı sistemine göre oynanacak. Seri başı olacak 27 takım öncelikle 2012-2013 sezonunda yer aldıkları ligler, ardından 2011-2012 sezonu baz alınarak play-off birincilikleri, eşitliğin devam etmesi halinde Futbol Müsabaka Talimatı'nda puan eşitliği halinde uygulanacak esasların göz önüne alınması suretiyle belirlenecek.  

Bu kriterlere göre yapılan sıralamada ilk 27 sırada yer alan takımlar seri başı olacak ve kalan 27 takımla eşleşecek. Eşleşmeler kura çekimiyle belirlenip, müsabakalar, tek maç eleme usulüne göre, küçük numarayı çeken takımın sahasında oynanacak. Müsabakaları kazanan 27 takım tur atlayacak. 

Dördüncü Eleme Turu: