Gözaltında tutulduğu Terörle Mücadele Şube Müdürlüğünden Beşiktaş'taki İstanbul Adliyesine getirilen Büyük, ''Balyoz Planı'' soruşturmasının Gölcük'te ele geçirilen belgelere ilişkin ayağını soruşturan özel yetkili İstanbul Cumhuriyet Savcısı Hüseyin Ayar tarafından sorgulandı.

Savcı Ayar, Büyük'ü, tutuklanması istemiyle İstanbul Nöbetçi 13. Ağır Ceza Mahkemesine sevk etti. Mahkemece tekrar sorgulanan Büyük, tutuklanarak Metris Cezaevine gönderildi.

Emniyet birimlerine gelen bir ihbarın değerlendirilmesi sonucu Hakan Büyük'ün Eskişehir'deki evinde yapılan aramada ele geçirilen belgeler, ''Balyoz Planı''na ilişkin bilgiler içermesi dolayısıyla, aynı konuda yargılama yapan İstanbul 10. Ağır Ceza Mahkemesine gönderilmişti.